針式過濾器有不同的膜材質，不同材質的膜應用不同，應該根據實驗需要選取適合樣本過濾的膜，將針式過濾器連接到注射器上，要輕輕擰緊以保證密封良好，針式過濾器分滅菌和非無菌兩種類型，滅菌型針式過濾器使用前需進行預處理，過濾器安裝完成后用清水對過濾系統進行沖洗，沖洗干凈后可進行過濾操作，在吸入樣本前，需向注射器內吸取約1ml的空氣，這樣可以使液體殘留最小化，操作時要按步驟進行，以保證回收效率，先將樣品吸入注射器中，倒置注射器并將頂端的所有殘留物清楚干凈，然后將注射器內的樣品過濾后注入樣品瓶中，最后取下過濾器，將空氣吸入注射器、重新連接過濾頭、推出所有殘留樣品。
 

 

　　在針式過濾器的使用過程中，一定不能太用勁，以免把濾膜沖破，失去原本的過濾作用。有一些基質比較復雜的樣品溶液，特別是脂肪或大分子蛋白未除去的，或是乳化的溶液，在過膜的過程中會特別困難，堵濾膜，過濾不動，這個時候你就不要執著使勁了，換一個新的再過濾一下。除此之外，還應注意以下幾點：
 

　　1、有色素的樣品溶液經過濾膜之后，濾膜變成了紅色，上機進樣后發現赤蘚紅一點沒有了，才知道是濾膜吸附了赤蘚紅色素。因此針式過濾器過濾有色素的溶劑時一定做實驗驗證，選擇不會吸附所有色素的濾膜。
 

　　2、嚴格選擇適合的濾膜，樣品溶液是有機相的，一定選用有機的濾膜，水相的選用水相專用的濾膜，濾膜盒子上都有標記，注意區分。像那種1:1的水相有機相的，兩種膜都過濾一遍，嚴格控制任何雜質的進入。
 

　　3、無論是存放時，還是取用時，一定注意袋裝封口保存，取用時保證手套和工具的清潔，交叉污染是最難解決，最難處理的事情。